Analyse et diffusion des données

Étape 11

L’analyse des données pour le SMSS a deux grands objectifs :

Suivre et soutenir la collecte de données
Partager les résultats avec les parties prenantes nationales et internationales.

Cette section se concentre sur le deuxième objectif. Elle décrit l’analyse des données permettant de générer des taux de mortalité, des taux par cause spécifique et d’autres indicateurs pertinents à l’usage des parties prenantes. La vérification de la collecte des données et la génération de données d’assurance qualité ont été présentées à l’étape 10.

Intranet pour l’analyse des données

Afin de favoriser la collaboration au sein du projet, un portail web convivial peut être utilisé pour stocker les données nettoyées, les codes statistiques standard et les analyses ad hoc. Un tel portail permet de répondre rapidement aux requêtes, favorise la reproductibilité et aide à suivre les différentes analyses menées par l’équipe du projet. L’étape 5 décrit la configuration du portail.

Dans le cadre du projet SIS-COVE au Mozambique, les données brutes sont régulièrement nettoyées, remodelées et intégrées dans un portail qui permet une collaboration à distance sur l’analyse des données et archive toutes les analyses afin qu’elles puissent être facilement reproduites. Le portail est utilisé comme une plateforme commune pour la gestion et l’analyse des données. Des règles claires doivent être établies concernant le lieu où chaque activité de traitement des données a lieu, avec des conventions de nommage et de numérotation guidées, y compris la manière de modifier les codes.

Intranet pour l’analyse des données pour le SIS-COVE au Mozambique

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Données sur la mortalité

Vous trouverez ci-dessous une description des indicateurs de mortalité de base et des désagrégateurs qui sont régulièrement calculés par le système, dans les catégories suivantes : caractéristiques de la population, événements d’état civil et taux.

Composition de la population — Les caractéristiques de la composition de la population peuvent être ventilées par âge et sexe, zone de résidence et province ou région.

Évènements d’état civil — La proportion des naissances (naissances vivantes, mort-nés, fausses couches) et des décès peut être ventilée par âge et sexe, zone de résidence et province ou région.

Taux — La fiabilité des indicateurs sera évaluée en calculant l’erreur type des estimations et, par conséquent, les intervalles de confiance des paramètres démographiques. Les principaux indicateurs sont les suivants : taux brut de natalité (TBN), taux brut de mortalité (TBM), taux de fécondité (TFR), taux de mortalité infantile (TMI), le taux de mortalité néonatale (TMN), le taux de mortalité post-néonatale (TPMN), le taux de mortalité infantile (TMI), le taux de mortalité des moins de 5 ans (TM5A), le taux de mortinatalité (TMN), le taux de mortalité périnatale (TMP) et le taux de mortalité par âge (TMA). Voir la liste des indicateurs et des définitions.

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Analyse des données issues des autopsies verbales et sociales

Plusieurs méthodes ont été mises au point pour analyser les données d’autopsie verbale afin de déterminer la répartition des causes de décès au sein d’une population. Ces méthodes comprennent le codage médical des causes de décès par autopsie verbale (PCVA) et les méthodes de codage informatique des autopsies verbales (CCVA). Alors que la PCVA repose sur l’examen des données d’autopsie verbale par des médecins et l’attribution d’une cause probable de décès, la CCVA utilise des algorithmes informatiques définis par des experts pour attribuer la cause probable de décès à partir des données d’autopsie verbale.1 Les méthodes CCVA les plus populaires comprennent InterVA, InsilicoVA, Expert Algorithm VA, SmartVA (ou Tariff), etc.2 3 4 Toutes les méthodes ont leurs avantages et leurs limites. Cependant, l’utilisation des approches CCVA garantit l’objectivité et l’analyse rapide des données. L’OMS approuve et recommande désormais plusieurs méthodes CCVA, dont beaucoup sont incluses dans le logiciel « OpenVA » qui fonctionne actuellement avec le progiciel statistique R. La PCVA nécessite beaucoup de ressources, détourne les médecins de leurs tâches cliniques, peut être biaisée par les expériences cliniques variées des médecins codeurs et manque d’objectivité et d’uniformité dans l’application des critères diagnostiques. Néanmoins, certains chercheurs privilégient la PCVA, et certains contextes peuvent la préférer. 5

Attribution des causes de décès

Les causes de décès (COD) peuvent être attribuées à chaque cas de décès à l’aide de plusieurs méthodes CCVA. Le COMSA/SIS-COVE du Mozambique utilise trois algorithmes CCVA différents : InterVA5, InSilicoVA et l’algorithme Verbal Autopsy Expert Algorithm (EAVA). Ces trois algorithmes CCVA sont comparables, reproductibles, rapides et réalisables dans des contextes où les ressources sont limitées. Les algorithmes diffèrent dans leur utilisation et leur détermination des causes de décès. Pour chaque décès, les attributions de causes par deux ou trois algorithmes peuvent être concordantes ou divergentes, en fonction des réponses aux informations sur les symptômes issus de l’entretien d’autopsie verbale de l’OMS 2016. Il peut être avantageux d’utiliser plusieurs algorithmes pour obtenir les causes, car il n’est pas certain que l’un d’entre eux produira les estimations les plus précises des COD, et chacun présente des avantages et des inconvénients. Par exemple, InterVA a été développé au fil de nombreuses années et est largement utilisé et validé. Cependant, InterVA5 ne fait pas la distinction entre un symptôme manquant (« ne sait pas », « a refusé de répondre ») et absent (« non »). InSilicoVA prend en compte les réponses manquantes par rapport aux réponses absentes et élimine les « indéterminés », mais nécessite un temps de calcul relativement plus long. La relation entre la cause et les symptômes donnée par EAVA est la plus transparente et la plus intuitive, mais la hiérarchie des causes utilisées a une forte incidence sur les résultats. Les trois algorithmes font l’objet d’améliorations continues. InterVA5 et InSilicoVA nécessitent le package OpenVA, et les trois algorithmes sont exécutés à l’aide du logiciel statistique R.

Les données d’autopsie verbale sont traitées à l’aide d’une série de scripts afin d’attribuer une cause de décès. La première étape consiste à adapter les noms des variables et les options de réponse afin qu’ils correspondent aux formats d’entrée de l’algorithme CCVA. Le guide d’utilisation InterVA-5.1 de Peter Byass fournit des conseils utiles sur les données d’entrée requises par les algorithmes. Le tableau entre les pages 11 et 12 traduit les noms des variables de l’OMS 2016 en ceux utilisés par InterVA5 et InSilicoVA. Par exemple, pour convertir les variables et les valeurs du format du questionnaire VA 2016 de l’OMS au format du package OpenVA R, la question Id10019 - Quel est le sexe du défunt ? - est recodée en deux questions Oui ou Non : i019a et i019b. Les valeurs de réponse sont « Y » pour les hommes et « N » pour les femmes pour i019a, et « N » pour les hommes et « Y » pour les femmes pour i019b. Les réponses manquantes, inconnues et refusées sont codées par un point « . ». Ce processus de mappage doit être effectué manuellement et vérifié régulièrement, à mesure que les données entrantes sont mises à jour. Les variables et les réponses du questionnaire VA restent dans leur format de collecte pour l’EAVA. L’algorithme EAVA crée une base de données indiquant la présence ou l’absence d’un diagnostic, sur la base des symptômes signalés. Les causes sont ensuite attribuées à chaque groupe d’âge en fonction d’une hiérarchie des causes.

Une fois que la cause spécifique a été déterminée par InterVA, InSilicoVA et EAVA pour chaque décès, les causes sont regroupées en catégories de causes plus larges par groupe d’âge. Les causes néonatales générales sont généralement les malformations congénitales, les infections, les événements liés à l’accouchement, la prématurité et toutes les autres causes. Les causes générales chez les enfants sont le paludisme, la pneumonie, la diarrhée, la malnutrition sévère, le VIH, d’autres infections et autres. Les causes chez les adultes comprennent le cancer, la diarrhée, le VIH, les blessures, le paludisme, les causes maternelles, autres, autres infections, la pneumonie, la tuberculose et les maladies cardiovasculaires.

Analyse d’autopsie sociale

Bien qu’il soit important de connaître les causes biologiques de la mortalité infantile, la mise en œuvre efficace des interventions visant à améliorer la survie dépend d’une meilleure compréhension des facteurs culturels, sociaux et liés au système de santé qui peuvent être modifiés et qui influent sur l’accès aux soins de santé et leur utilisation. Les instruments d’autopsie sociale permettent de collecter les données nécessaires pour établir un lien entre la maladie mortelle ou le diagnostic ou la reconnaissance de cette maladie et un ensemble de conditions ou de facteurs sociodémographiques, économiques et culturels, permettant ainsi d’établir un « diagnostic » social des décès.6 Une analyse descriptive des données sur les soins préventifs et curatifs est réalisée, en s’appuyant sur la couverture des indicateurs clés tout au long du continuum des soins normaux (pour les enfants de moins de cinq ans) et sur l’ e les étapes de reconnaissance de la maladie et de recherche de soins pour les maladies dans le modèle Pathway to Survival. 7

Les résultats de l’autopsie sociale détaillent : - les facteurs au niveau des ménages, tels que le niveau d’éducation de la mère et du père, les soins pendant la grossesse et les soins de bien-être, la recherche de soins et les contraintes ; - les facteurs communautaires, tels que le lieu de résidence, le temps nécessaire pour accéder aux soins de santé en cas d’urgence et le capital social ; - et les facteurs liés au système de santé, tels que le contenu des soins prénatals, les soins lors de l’accouchement, les soins aux nouveau-nés et aux enfants, et la recherche de soins en cas de maladie.

Le cadre conceptuel « Pathway to Survival » est utilisé pour organiser les étapes que les familles, les communautés et les systèmes de santé doivent suivre pour prévenir les maladies et rétablir la santé des enfants malades. Les résultats de l’autopsie sociale sont utiles pour orienter la mise en œuvre efficace des stratégies de survie de l’enfant en éclairant l’élaboration des politiques et des programmes de santé afin d’améliorer l’accès et l’utilisation des soins de santé préventifs et curatifs.

Pour les nouveau-nés, outre l’examen de la couverture en matière de reconnaissance des maladies, de soins prodigués, de recours aux soins et de qualité des soins de santé à chaque étape du parcours vers la survie, nous évaluons l’âge médian des nouveau-nés en jours au moment de l’apparition de la maladie, défini comme l’âge auquel les premiers symptômes de la maladie mortelle ont été reconnus, la durée médiane de la maladie en jours, définie comme le temps écoulé entre l’apparition de la maladie et le décès, et la perception qu’ont les soignants de la gravité de la maladie des enfants au moment de son apparition, lorsqu’ils ont décidé pour la première fois de recourir à des soins de santé formels, et à la sortie du premier établissement de soins formel.

Nous présentons certains des principaux cadres utilisés pour organiser les indicateurs de l’autopsie sociale. Si la plupart de ces cadres ont été initialement conçus pour soutenir l’approche de prise en charge intégrée des maladies infantiles dans le domaine des soins de santé infantile, ils peuvent également être utilisés pour décrire une approche visant à réduire la mortalité adulte.

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Caractéristiques démographiques et familiales des personnes décédées

Ceci est présenté sous la forme d’un tableau descriptif qui décrit les caractéristiques sociodémographiques des répondants, des personnes décédées et de leurs ménages.

Les caractéristiques des personnes interrogées comprennent leur âge, leur niveau d’éducation et/ou d’alphabétisation, leur situation matrimoniale, etc. Les caractéristiques des personnes décédées comprennent l’âge, le sexe, l’âge au moment de l’apparition de la maladie, le niveau d’éducation, la situation matrimoniale, etc. Les caractéristiques des ménages concernent les biens possédés, l’utilisation de sources d’eau potable améliorées, l’utilisation de sources d’assainissement améliorées, l’utilisation d’électricité/générateur/énergie solaire pour l’éclairage, les caractéristiques des sols et des murs, le quintile de l’indice de richesse, la densité des ménages et le temps de trajet jusqu’à l’établissement de santé le plus proche, etc.

Chemin vers la survie

Le modèle « Pathway to Survival » identifie et organise les facteurs sociaux, culturels et liés au système de santé qui pourraient être modifiés tant au sein du foyer que dans la communauté afin de prévenir les maladies infantiles et de rétablir la santé des enfants malades.8 Le modèle « Pathway to Survival » décrit ces pratiques de soins préventifs et curatifs bénéfiques pour la santé. Bien qu’il ait été initialement conçu pour soutenir l’approche de prise en charge intégrée des maladies de l’enfant (PCIME) en matière de soins de santé infantile, ce modèle peut également être utilisé pour décrire une approche visant à réduire considérablement la mortalité adulte. Les questions SA du questionnaire COMSA/SIS-COVE sont basées sur ce modèle.

Couverture des indicateurs clés tout au long du continuum de soins (pour l’ensemble des enfants de moins de cinq ans)

Le continuum de soins, thème récurrent dans la littérature sur la santé maternelle, néonatale et infantile, est implicite dans le modèle « Pathway to Survival ».9 Les interventions examinées dans le continuum de soins et liées au cadre « Pathway to Survival » sont classées selon les stratégies de prestation de services tout au long du continuum et comprennent des interventions préventives clés, à domicile ou à l’extérieur, pour lesquelles il existe un niveau raisonnable de preuves d’efficacité et qui favorisent le bien-être des personnes.10 11 Toutes les interventions examinées se sont révélées efficaces et efficientes pour promouvoir la survie des enfants et sont donc incluses parmi les interventions examinées par l’outil « Lives Saved (LiST)12 » ou recommandé par l’Organisation mondiale de la santé (OMS), et devraient donc être accessibles à tous les

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Contenu des soins prénatals pendant la grossesse ayant abouti à des mortinaissances ou à des décès néonatals

Les composantes des soins prénatals (CPN) reçus par les mères d’enfants mort-nés ou décédés qui ont effectué au moins une visite pendant leur grossesse peuvent être évaluées à travers cinq interventions, comme le montre le tableau ci-dessous.

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Autres indicateurs clés et pertinents

Les données COMSA/SIS-COVE offrent une occasion unique d’analyser les complications liées à la grossesse et à l’accouchement chez les mères.

[ADD TABLE 12 FOR PREGNANCY COMPLICATIONS] [ADD TABLE 13 FOR L&D COMPLICATIONS]

Diffusion

La diffusion régulière des résultats aux parties prenantes concernées et la communication des données SMSS aux agences internationales telles que l’ONU et l’OMS sont des éléments essentiels d’un cadre décisionnel efficace fondé sur des données probantes. En adoptant ces pratiques, les pays peuvent améliorer leurs processus d’élaboration des politiques de santé, garantir une plus grande transparence et fournir des données précieuses à la communauté mondiale de la santé.

Site web public

Le site web public sert à décrire et à promouvoir le projet et les agences qui le soutiennent, en présentant les objectifs, les méthodes et les personnes impliquées. Selon le contexte, il peut être préférable de présenter le site web en plusieurs langues.

Accès public aux données

Exemple de site web public COMSA/SIS-COVE

comsamozambique.org [LINK TO BE FIXED]

Informations sur les données
Accès aux données publiques
Visualisation des données

Le projet doit également fournir un mécanisme permettant aux chercheurs et au public d’accéder aux données. Cela peut se faire via le site web du projet ; en général, pour accéder aux ensembles de données, un visiteur doit s’inscrire et accepter les conditions d’utilisation des données. Il obtient alors immédiatement l’accès aux téléchargements des données sur la population, les événements et les causes de décès. Les téléchargements de données sont enregistrés dans le système. Il est possible de créer un référentiel de données sans site web public de type brochure. Les bibliothèques universitaires offrent ce service et il existe des progiciels pouvant servir de point de départ. Les archives de données NADA en sont un exemple : https://nada.ihsn.org/.

Produits de communication

Exemple COMSA/SIS-COVE:

Exemples de produits de communication développés

Le projet doit élaborer un plan de communication stratégique afin de garantir que les enseignements tirés du projet atteignent les bons publics avec les bons messages par les bons canaux. Il est essentiel de combiner des documents techniques plus longs et des documents plus courts destinés au grand public afin de transmettre les informations à un large éventail de parties prenantes. Il est important d’utiliser efficacement la visualisation des données afin de garantir leur compréhension aisée. L’élaboration d’une palette de couleurs standard, d’une image de marque et de directives graphiques garantit la cohérence des documents.

Pour en savoir plus:

[REFERENCES TO BE FIXED]

Glossaire UNdata.org – Site web fournissant des informations sur le calcul des taux de natalité et de mortalité décrits ci-dessus.
Guide d’utilisation InterVA-5.1 de Peter Byass
Communications stratégiques de l’OMS : cadre pour une communication efficace
Liste des publications sur le site web COMSA/SIS-COVE
Ressources de l’Organisation mondiale de la santé sur l’autopsie verbale
Algorithme d’autopsie verbale InsilicoVA
Algorithme d’autopsie verbale InterVA
Autopsie verbale par algorithme expert (EAVA)
Kalter et al. (2016) Validation d’algorithmes experts hiérarchiques d’autopsie verbale dans un vaste ensemble de données avec causes de décès connues – Article de revue évalué par des pairs décrivant les performances de la méthode EAVA

Étape 11 Ressources